تضم دار الكتب مجموعة نادرة من المخطوطات يبلغ عددها حوالي ستين الف مخطوط، كتبت بالعربية والتركية والفارسية على مدى قرون طويلة في مختلف الفنون مثل العلوم الدينية، والعلوم الطبيعية، والرياضيات، والشعر، وعلوم اللغة، والتاريخ، وعلوم الإجتماع، وتضم أيضاً مجموعة من أوراق البردي، وخرائط، ولوحات وألبومات خطية، وأغلفة كتب منفصلة، وأوائل المطبوعات، ودوريات، وأكثر من ١٢ ألف مسكوكة من عملات وميداليات وغيرها. وتفخر دار الكتب بأن تعرض بمتحفها في باب الخلق مجموعة مختارة من نفائس مقتنياتها، وإتاحة الفرصة للجمهور للاطلاع على الارث الفكري والفني للعالم الاسلامي.